1、公式不同：所有者权益的账面价值=所有的资产账面价值-所有负债的账面价值，所有者权益的账面价值是包括商誉的。可辨认净资产的账面价值=可辨认资产的账面价值-可辨认负债的账面价值，一般情况下，负债均是可辨认的，而可辨认资产=总资产-商誉，因为商誉是不可辨认的资产。

2、程度不同：可辨认净资产的公允价值=可辨认资产的公允价值-可辨认负债的公允价值。所有者权益的公允价值=净资产的公允价值=可辨认净资产的公允价值+商誉。净资产的账面价值(包括商誉)就是可辨认净资产的账面价值+商誉。

3、取得方式不同，公允价值需要在市场环境下取得，账面价值是购买时取得的余额减去相关备抵科目。

4、表示的含义不同，公允价是是对资产在当前市场的评估，而账面价值仅仅显示取得时到当前的剩余价值。

对资产价值的描述准确度不同，公允价值对资产价值的描述更加准确，账面价值有时不够准确。

资产的公允价值也就是市场价值，或者是合同或者协议价值。资产的账面价值=固定资产净额。即固定资产的原价-计提的减值准备-计提的累计折旧。账面价值是指某科目(通常是资产类科目)的账面余额减去相关备抵项目后的净额。然而公允价值就是市场价/合同协议价。

所有者权益是由企业资产和负债根据账面价值核算出的所有者享有的剩余权益。而可辨认净资产公允价值份额是根据企业资产和负债的公允价值计算出的。

净资产公允价值与净资产账面价值之间的差额即为被并企业净资产的升值或贬值部分；购买企业投资成本与被并企业净资产公允价值之间的差额为商誉或负商誉（见“商誉和负商誉”）；

在完全权益法下对上述差额必须在资产受益期内予以摊销，故公允价值是确定商誉价值的重要依据之一（见“权益法”）。虽然在权益结合法下按账面价值入账，但公允价值对其仍有特殊意义，即公允价值仍然作为确定换取净资产应付的股份数的依据，以使交易更加合理。

采用价值评估模型确定金融商品的公允价值时，应该注意以下事项：

（1）谨慎使用价值评估模型，对于所使用的模型应该了解其理论假设、内在限制以及常被使用在哪些方面，特别是常被使用于哪些市场中的哪些金融产品等；

（2）使用者应该具备金融商品知识，了解各种金融商品的特点、市场惯例以及利率、汇率等经济量的变动对其价格或现金流量的影响；

（3）注意模型使用的合理性，风险管理和其他控制管理部门人员应该注意模型的评估结果与市场是否一致，模型是否陈旧或已经更新，是否有其他市场信息可以用于调整模型等。

参考资料：百度百科-公允价值