小规模纳税人只能开具普通发票，他去税务机关申请代开增值税专用发票给他客户，请问，对他自己而言，是不是和他自己开出的普通发票税率是一样的？是不是3%？

是的税率都是3%，只是发票是增值税专用发票

问题描述： 　　问：公司因业务需要，需要到税务局代 开一张发 票，代为开具的发 票申请单上加盖什么印章？是财务专用章、发票专用章还是公司公章？有具体制度规定吗？文号是多少？ 问题答复：
　　答：根据国家税务总局《关于代 开 增值税专用发 票管理办法》的通知规定（国税发[2004]153号）：增值税纳税人应在代 开 专用发 票备注栏上，加盖本单位的财务专用章或发 票专用章。
 

可以代开。
根据国家税务总局货物和劳务税司发布的《关于做好增值税发票使用宣传辅导有关工作的通知》税总货便函〔2017〕127号文
第二章第二节 税务机关代开发票基本规定
一、代开发票范围
(一)已办理税务登记的小规模纳税人(包括个体工商户)以及国家税务总局确定的其他可予代开增值税专用发票的纳税人，发生增值税应税行为，可以申请代开增值税专用发票。
(二)有下列情形之一的，可以向税务机关申请代开增值税普通发票：
1.被税务机关依法收缴发票或者停止发售发票的纳税人，取得经营收入需要开具增值税普通发票的；
2.正在申请办理税务登记的单位和个人，对其自领取营业执照之日起至取得税务登记证件期间发生的业务收入需要开具增值税普通发票的；
3.应办理税务登记而未办理的单位和个人，主管税务机关应当依法予以处理，并在补办税务登记手续后，对其自领取营业执照之日起至取得税务登记证件期间发生的业务收入需要开具增值税普通发票的；
4.依法不需要办理税务登记的单位和个人，临时取得收入，需要开具增值税普通发票的。
二、代开发票种类
国税机关和地税机关使用新系统代开增值税专用发票和增值税普通发票。代开增值税专用发票使用六联票，代开增值税普通发票使用五联票。
国税机关为增值税纳税人代开的增值税专用发票，第五联代开发票岗位留存，以备发票的扫描补录；第六联交税款征收岗位，用于代开发票税额与征收税款的定期核对；其他联次交增值税纳税人。地税机关为纳税人代开的增值税专用发票，第四联由代开发票岗位留存，以备发票扫描补录第五联交征收岗位留存，用于代开发票与征收税款的定期核对；其他联次交纳税人。