纳税人的义务有：依法纳税的义务、按时缴纳税款的义务、扣缴义务人代扣、代收税款的义务、依法进行税务登记的义务、及时提供信息的义务、接受检查的义务。
纳税人、扣缴义务人在税务机关实施税务检查过程中应履行的义务主要有两方面，一是纳税人、扣缴义务人必须接受税务机关依法进行的税务检查，这里所讲的“依法”，是指税务机关应当根据法律、行政法规的规定，依照法定的职权和法定的程序来进行税务检查，换句话说，纳税人、扣缴义务人对违反法律、行政法规规定的或不符合法律、行政法规规定范围和程序的税务检查，都有权拒绝接受。 例如，本法规定税务机关派出的人员进行税务检查时，应当出示税务检查证件，那么对于未出示税务检查证件的，纳税人、扣缴义务人就有权拒绝检查。二是纳税人、扣缴义务人必须如实反映情况，提供有关资料，不得拒绝、隐瞒，这是对纳税人、扣缴义务人在接受税务机关依法进行的税务检查过程中的要求。
税务检查的主要对象是纳税人、扣缴义务人的生产、经营情况，通常这些情况是通过帐簿、资料及其他实物形态等反映出来的，因此纳税人、扣缴义务人在接受税务机关的检查时向税务机关提供的情况和资料是否真实、准确，直接影响到税务检查的结果。 影响到国家的税收收入及纳税人、扣缴义务人自身的利益，只有如实反映情况，提供有关资料，才能保证税务检查这种行政执法活动有效进行，任何拒绝税务检查和隐瞒情况及资料的行为，都是违反税务管理的违法行为，对这种行为税务机关可以依法给予一定的处罚。
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