预算编制应当遵守国家编制预算的原则，按照编制办法和程序进行。科研项目经费预算编制原则：科研项目经费预算编制原则是目标相关性、政策相符性、经济合理性。
科研课题经费预算的编制是科技计划经费管理的重要环节,是课题预算评审评估和课题经费安排的重要依据。自2001年国家高新技术研究发展计划等项目研究全面实施课题制管理以来,科研课题经费预算,几乎成了各渠道课题申报的必备材料。 编制预算应该遵循原则
1、坚持量入为出和“一要吃饭，二要建设”的原则。根据收入和财力的可能安排预算，做到量力而行，收支平衡。
2、坚持实事求是的原则。切实做到收支计划积极稳妥，杜绝瞒报、虚报的现象。
3、坚持综合预算的原则。实施预算内外资金统筹安排。
4、坚持部门预算的原则。部门预算作为一个单位的总预算，是涵盖单位的所有资金的收支预算，既包括本级预算又包括其下属单位预算，既包括正常经费预算又包括专项经费预算。 5、坚持零基预算的原则。人员经费按标准核定，公用经费按部门分类分档的定额核定，事业发展和建设项目按轻重缓急排序。
6、坚持一般不予调整预算的原则。部门支出预算确定以后，除突发性事件和政策性因素增加的必不可少开支，并经财政审核后报市人大批准调整预算外，其它支出项目当年财政不予追加，一律在编制下年度预算时考虑。
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