计入管理费用科目；业务部门发生的医药费，计入销售费用科目；生产部门等发生的医药费，计入制造费用科目。

若企业未参加医疗统筹(社保)，员工报销的个人医药费可以列入职工福利费，按规定在企业所得税税前扣除；若企业已参加医疗统筹(社保)，在缴纳医疗保险费之外又给员工报销医疗费用，不能在企业所得税前扣除。

企业应当在实际发生时根据实际发生额编制分录：

借：制造费用、管理费用、销售费用等

贷：应付职工薪酬——职工福利费

借：应付职工薪酬——职工福利费

贷：库存现金

《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》(国税函[2009]3号)第三条的规定，职工卫生保健、生活、住房、交通等所发放的各项补贴和非货币性福利，包括企业向职工发放的因公外地就医费用、未实行医疗统筹企业职工医疗费用、职工供养直系亲属医疗补贴、供暖费补贴、职工防暑降温费、职工困难补贴、救济费、职工食堂经费补贴、职工交通补贴等，属于《实施条例》第四十条规定的企业职工福利费。

资料扩展：

管理费用是指企业行政管理部门为组织和管理生产经营活动而发生的各种费用。包括的具体项目有:企业董事会和行政管理部门在企业经营管理中发生的，或者应当由企业统一负担的公司经费、工会经费、待业保险费、劳动保险费、董事会费、聘请中介机构费、咨询费、诉讼费、业务招待费、办公费、差旅费、邮电费、绿化费、管理人员工资及福利费等。

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