母基金的设立是由省级政府发起设立PPP母基金，母基金出资人为省政府出资平台、金融机构和其他出资人，一般省政府只出资其中一小部分，基金出资主要来自于银行、保险、信托等金融机构，有时深耕某个行业的实体公司也会参与。母基金规模通常不会很大，而是通过小比例投资多个由当地政府(市、县级政府)发起成立的PPP子基金，起到引导PPP项目投向的作用。
分级指基的母基金相当于普通的指数基金，可以申购赎回，不直接在场内交易，但可分拆为两类子份额上市交易；a、b两类份额直接申购赎回，但基本均在场内上市交易(瑞福优先例外).a、b份额按比例配对，通常为1:1(也有4:6)，a类份额每年获得约定收益，b类份额除了支付a类份额的约定收益(相当于融资成本)外，还承担剩余的损失或享受剩余的收益。 分级指基的模式，说到底是b类份额按比例向a类份额融资购买指数基金(如1:1)，由于a份额拿约定收益(通常为6%~7%)，净值基本在1~1.07元之间，b类份额承担市场波动，单位净值通常在下折和上折阀值间波动(通常为0.25元~2元左右).
由于a、b份额配比固定，b类份额的净值越低的时候，相当于融资的实际杠杆越高，反之越低。而对于投资杠杆指基的投资者而言，某种程度上是在追求杠杆倍数，杠杆倍数越高愿意支付更高溢价。
从a、b份额折溢价平衡角度，由于场内外套利机制存在，分级指基整体会保持场内外净值和价格平衡。若以1:1的比例来看，a类份额由于常是折价，b类份额溢价，假设a类份额折价0.1元，那么b类份额溢价0.1元。在b类的净值越低时，0.1元意味的溢价率也越高。 上折意味着杠杆倍数突然由低到高，溢价率会增高；下折意味着杠杆倍数骤然由高到低，溢价率会降低。不过，有一点不同，下折时杠杆指基的资产折算后仍全部为杠杆指基份额；上折时份额则不变，超出1元的份额转为母基金，将使得超出部分折算前享受的溢价消失。
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