财务报表分析的局限性有报表分析本身的滞后性、现金流比率的局限性、会计方法本身的局限性、财务报表的真实性问题、会计计量方法的局限性。

1.报表分析本身的滞后性。财务报告对外披露的财务信息的有用性在很大程度上取决于它的及时性，对于会计信息的使用人来讲，会计信息的披露和传递是越快越好。就企业年度财务报表而言，所披露的会计信息间隔时间越长，就越缺乏有用性。

2.现金流量比率的局限性。分析中所采用的现金流量指标一般是以经营活动现金流量为基础来讲的,但是不同企业或同一企业不同会计期间的经营活动现金流量有很大差别,使上述指标在横向和纵向可比性上都存在较大的缺陷。

3.会计方法本身的局限性。列入报表的仅仅是可以利用的、可以用货币计量的经济资源,我们对报表的分析仅仅是分析了那些报表中列示的经济资源,实际上,企业有许多经济资源或是受客观条件制约、或是受会计方法的制约而并未在报表中得到体现。

4.财务报表的真实性问题。在很多情况下,企业出于各种目的,会出现人为操纵的结果,这极有可能使信息使用者得到的报表信息与企业实际状况相距甚远,从而误导信息使用者。

5.会计计量方法的局限性。会计所提供的主要是企业经济活动是可以用货币计量的数据和信息。然而就用货币单位作为会计统一的计量尺度,实质上存在着货币是稳定的这一假设,然而由于通货膨胀,财务报表所提供的财务信息也就不能反映当时真实的成本费用和收益状况。