基层税收治理体系和治理能力方面存在的差距不足如下：①基层工作队伍力量不强；②基层党员教育学习管理不够到位；③日常工作中存在疲于应付事务性工作多。
存在问题的根本原因分析：是虽然各村两委按照换届要求，配齐配强了村两委主要负责人，但储如村级社长、村两委小三职干部因为职务级别、薪酬标准等原因职能作用发挥不够好，几乎村级基层治理工作重任主要压在村两委主要领导肩上，全县各乡村情况基本类同，只是存在程度不同的问题。同时当前在市场经济的影响下，部分基层党员流动性大，接受教育和组织生活存在一定的难度，甚至个别基层党员在基层治理中不仅不发挥先锋模范带头作用，有时恰恰起一起负面作用，对于促进基层治理造成一定的困难。当前在转职能转作风高标准要求下，乡村两级面临十分重大的工作压力。