与手工会计系统比较，计算机会计系统的特点有：运用计算机来处理经济业务，但并没有改变会计的基本原理。并且，和手工会计一样都要遵循基本的会计理论和会计方法。

1）数据结构

在会计工作中，广泛运用计算机来处理经济业务，是会计技术上的革命，但并没有改变会计的基本原理。会计电算化仍然要遵循复式记账的基本原理，对发生的经济业务都要运用复式记账原理，编制会计分录，登记账户，然后编制会计报表。

无论是手工会计还是电算化会计，终目标都是为了加强经济管理，提供会计信息，进行经济预测，参与经营决策，提高经济效益，手工会计或电算化会计要达到系统目标，都必须经过数据的收集、加工、处理和传输，从价值方面入手来控制经济活动，努力实现以尽量少的投入，达到尽量大的产出。

2）原理和功能

都要遵循基本的会计理论和会计方法。电算化会计会引起会计理论和会计方法上的变化，但这种变化是渐进型的，而不是突变型的，电算化会计必须遵循基本的会计理论和会计方法。

都必须保存会计档案。会计档案是会计的重要历史资料，必须按照规定妥善保管。实行电算化会计，大部分会计档案的物理性质发生了变化，由手工会计下纸质的会计档案变为磁性介质的会计档案，备份消失和复制都很容易。这就要求用更科学的方法，加强会计档案的保管。

3）会计理论和方法会计法规和准则共同遵守会计法规和会计准则。电算化会计不能置会计法规和会计准则于不顾，相反应当更严格地执行，从措施上、技术上杜绝可能的失误。

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