相比天津自由贸易试验区和广东自由贸易试验区，福建自由贸易试验区的申报过程显得有些曲折。从2013年12月12日起，厦门、福州等地纷纷上报自贸区方案，但由于原则上一个省最多只能获批一个自贸区，由省一级政府统一申报，2014年5月，福建省商务厅再次上报的新的方案。新方案中，不仅包括了厦门、平潭全岛和福州的江阴港区，还加入了泉州的一部分。
 
　　对比这两套方案不难发现，突出对台自由贸易都是福建自由贸易试验区*5的特色所在。作为两岸交流的最前沿，厦门一直都是申报的重点，而泉州作为福建经济总量*9大市，也是台湾最主要的祖籍地，更是海上丝绸之路最重要的起点。
 
　　相对于台湾，福建拥有更加丰富的土地和劳动力资源，劳动密集型和部分科技密集型产业的转移会为台商带来更大的竞争力。特别值得注意的是，福建自贸区建设实施方案提到，要在厦门个案突破开展两岸双向贷款业务。在金融领域，两岸跨境人民币业务是厦门金融业发展的一大特色和未来方向。
 
　　在申报自贸区的地区中，除了上述的三个“种子选手”外，四川、重庆、山东也被外界关注。但事实上，考虑到各个城市的战略地位、地理位置、发展基础等条件，能够成为下一个自贸区的候选者并不多。
 
　　自贸区不同于以往的经济特区。就上海自由贸易试验区而言，改革要大于政策，其框架中并没有让人垂涎的税收优惠政策。而且，自贸区实验“知易行难”，也是众所皆知。

 
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