两个自然人股东发生股权比例变更涉及哪些税？

问：我公司注册资金为100万元，由自然人A和A的兄弟B共同出资设立。其中，A出资60万元占比60%；B出资40万元占比40%.现A公司将持有公司20%的股权无偿转让给B.转让后A占比40%，B占比60%.转让时公司净资产为200万元（假定符合市场价值）。A将20%股权转让给B涉及哪些税？
答：1、《印花税暂行条例》*9条规定，在中华人民共和国境内书立、领受本条例所列举凭证的单位和个人，都是印花税的纳税义务人（以下简称纳税人），应当按照本条例规定缴纳印花税。
《国家税务局关于印花税若干具体问题的解释和规定的通知》（国税发[1991]155号）第十条规定，“财产所有权”转移书据的征税范围是：经政府管理机关登记注册的动产、不动产的所有权转移所立的书据，以及企业股权转让所立的书据。
《印花税暂行条例施行细则》第十八条规定，按金额比例贴花的应纳税凭证，未标明金额的，应按照凭证所载数量及国家牌价计算金额；没有国家牌价的，按市场价格计算金额，然后按规定税率计算应纳税额。
根据上述规定，A与B签订的无偿转让股权合同，A、B应按“产权转移书据”贴花，计税依据按转让20%股权的市场价格40万元（200*20%）确定，税率为万分之五。
2、A将股权无偿转让给B，不缴纳营业税。
3、《国家税务总局关于股权转让所得个人所得税计税依据核定问题的公告》（国家税务总局公告2010年第27号）*9条规定，自然人转让所投资企业股权（份）（以下简称股权转让）取得所得，按照公平交易价格计算并确定计税依据。
计税依据明显偏低且无正当理由的，主管税务机关可采用本公告列举的方法核定。
第二条规定，计税依据明显偏低且无正当理由的判定方法：
（一）符合下列情形之一且无正当理由的，可视为计税依据明显偏低：……
（二）本条*9项所称正当理由，是指以下情形：
3.将股权转让给配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人；
根据上述规定，A将股权低价转让给其兄弟B，属于计税依据明显偏低且有正当理由情形，税务机关有权核定A的计税依据。
参照《河北省地方税务局转发国家税务总局关于加强股权转让所得征收个人所得税管理的通知》（冀地税函[2009]119号）第四条规定，对无偿转让股权行为的管理。一是对于继承、遗产处分、直系亲属之间无偿赠予股权的情况，对当事双方不征收个人所得税。纳税人需要提供公证机构出具的赠与人和受赠人亲属关系的公证书、抚养关系或赡养关系公证书（或乡镇政府或街道办事处出具的抚养关系或赡养关系证明）、《继承公证书》等相关证明，并填写提交《个人股东变动情况报告表》，税务部门应认真审核并留存复印件。二是主管地方税务机关应深入调查无偿转让股权的真实性，做好后续管理工作，发现有问题的，应核定其转让价格，依法补征个人所得税，并依法进行处罚。三是对于无偿赠与再转让的股权，以股权转让收入减除受赠、转让股权过程中缴纳的税金及有关合理费用后的余额为应纳税所得额，按20%的适用税率计算缴纳个人所得税。
直系亲属主要是指配偶、父母、子女、养父母、养子女、继父母、继子女、兄弟姐妹、岳父母、祖父母、外祖父母及其他近亲属。遗产处分是指股权所有人死亡，依法取得股权的法定继承人、遗嘱继承人或者受遗赠人。
对于其他情形的自然人股东将股权无偿赠与他人的，受赠人因无偿受赠股权取得的受赠所得，按照“财产转让所得”项目缴纳个人所得税，税率为20%.
根据上述规定，A将持有贵公司20%股权无偿转让给兄弟B，不需缴纳个人所得税。
B取得受赠股权，按照现行个人所得税政策规定，不需缴纳个人所得税。