郑州国税局的机构设置有如下几方面：
 
　　内设机构：郑州市国家税务局设内设机构十三个，级别为正科级，分别为办公室、人事处、监察室、机关党委、教育处、财务管理处、收入核算处、货物和劳务税处、所得税管理处、大企业和国际税务管理处、政策法规处、征收管理处、进出口税收管理处。
 
　　事业单位：市局设事业单位2个，级别为正科级，分别为信息中心、机关服务中心。
 
　　直属机构：下辖两个直属机构，分别为郑州市国家税务局稽查局（副处级）、郑州市国家税务局车辆购置税征收管理分局（正科级）。
 
　　独立机构：下属十六个独立机构，包括六个县(市)局，十个城市区局，分别具有独立的法人地位。
　　六个县(市)局分别为：登封市国家税务局、巩义市国家税务局、新密市国家税务局、荥阳市国家税务局、新郑市国家税务局、中牟县国家税务局。
　　十个城市区局分别为：金水区国家税务局、管城区国家税务局、二七区国家税务局、中原区国家税务局、惠济区国家税务局、上街区国家税务局、经济开发区国家税务局（副处级）、高新技术产业开发区国家税务局（副处级）、郑州市国家税务局郑东新区分局（副处级）、航空港区国家税务局。

 
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