有限责任公司的自然人股东转让股权的行为不属于增值税应税行为，而自然人个人适用增值税小规模纳税人管理是在增值税上的涉税事项。

所以，根据财税[2019]13 号第三条的规定，享受减半征收印花税的是增值税小规模纳税人，自然人个人不属于增值税小规模纳税人，不能适用增值税小规模纳税人的政策。故，不可以减半征收印花税。

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相关规定：

《财政部 税务总局关于实施小微企业普惠性税收减免政策的通知》(财税[2019]13 号)

第三条，由省、自治区、直辖市人民政府根据本地区实际情况，以及宏观调控需要确定，对增值税小规模纳税人可以在 50%的税额幅度内减征资源税、城市维护建设税、房产税、城镇土地使用税、印花税(不含证券交易印花税)、耕地占用税和教育费附加、地方教育附加。